2012年12月28日，我园与中国科学院地球环境研究所签订科技合作协议。陕西省政协副主席、中国科学院院士周卫健研究员，中国科学院地球环境研究所所长曹军骥研究员，秦岭国家植物园园长沈茂才研究员、副园长刘书龙、崔汛，党总支书记赵辉远同志等出席了签字仪式。

周卫健副主席对沈园长十多年来的辛勤工作给予了高度赞扬，希望秦岭国家植物园为实现我省的“三强一富一美”目标做出应有的贡献。她说：秦岭国家植物园建设是一个非常好的项目，将科研、科普、保护有机的融合，符合党的十八大建设生态文明的要求，也是在建设生态文明方面做的一件实事。她希望秦岭国家植物园通过与地环所的合作，为园区项目多元化投入开个头，多渠道争取资金，相信秦岭国家植物园的未来非常美好。

此次合作，中国科学院地球环境研究所依托秦岭国家植物园建立长期定位观测站与观测样带，开展地球环境方面的持久深入研究，信息、数据共享，带动我国秦岭生态与环境研究水平，同时加大科研投入力度，为陕西省的环境治理、生物资源科学开发利用、生物多样性研究及保护、科技示范和科普教育等方面做出贡献。